Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NME3Q13232 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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