Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHAF1AQ13111 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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