Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
IFT88Q13099 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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