Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAF1Q13077 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAF1Q13077 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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