Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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PTPN13Q12923 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PTPN13Q12923 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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PTPN13Q12923 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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PTPN13Q12923 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
PTPN13Q12923 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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