Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FOXO1Q12778 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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