Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TTPAP49638 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
TTPAP49638 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
TTPAP49638 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TTPAP49638 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TTPAP49638 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TTPAP49638 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TTPAP49638 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TTPAP49638 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TTPAP49638 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TTPAP49638 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TTPAP49638 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
TTPAP49638 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms