Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
LMNB1P20700 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
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