Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms