Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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PDK4Q16654 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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PDK4Q16654 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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PDK4Q16654 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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PDK4Q16654 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PDK4Q16654 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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