Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SS18Q15532 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SS18Q15532 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms