Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SYCP1Q15431 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 GK-IT1-201ENST00000441146 397 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
SYCP1Q15431 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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