Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
BRD3Q15059 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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