Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
DDX39BQ13838 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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DDX39BQ13838 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDX39BQ13838 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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