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| RUNX3 | Q13761 | AC069366.1-201 | ENST00000583159 | 838 nt | BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC118757.1-201 | ENST00000586982 | 453 nt | TSL 2 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006504.2-201 | ENST00000589471 | 458 nt | TSL 3 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC114781.5-201 | ENST00000615297 | 108 nt | BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GXYLT1P4-203 | ENST00000616580 | 641 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR8G7P-201 | ENST00000616658 | 848 nt | BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC073869.7-201 | ENST00000640874 | 297 nt | BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC007491.1-202 | ENST00000637961 | 1576 nt | TSL 5 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PNLIPRP3-201 | ENST00000369230 | 2354 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | N4BP2L2-204 | ENST00000399396 | 2872 nt | TSL 5 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | LTN1-202 | ENST00000389194 | 7749 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C4orf36-203 | ENST00000473559 | 2306 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCDH15-217 | ENST00000414778 | 9234 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCDH15-227 | ENST00000614895 | 9249 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CCT6B-203 | ENST00000436961 | 1639 nt | TSL 2 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104623.2-202 | ENST00000623477 | 4002 nt | BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL031119.1-201 | ENST00000404707 | 1879 nt | BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZC3H14-215 | ENST00000555900 | 1762 nt | TSL 5 BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CFH-206 | ENST00000630130 | 1658 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AP000580.1-201 | ENST00000404439 | 358 nt | BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL049812.3-201 | ENST00000412348 | 417 nt | TSL 3 BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SVIL-AS1-202 | ENST00000414457 | 1243 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC009226.1-201 | ENST00000432413 | 539 nt | TSL 3 BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC087379.1-201 | ENST00000524613 | 993 nt | TSL 5 BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR8G5-201 | ENST00000524943 | 1041 nt | BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP006295.1-201 | ENST00000532605 | 585 nt | TSL 5 BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010197.1-201 | ENST00000541860 | 578 nt | TSL 4 BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC024909.1-201 | ENST00000549278 | 599 nt | TSL 4 BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BNIP3P5-201 | ENST00000562290 | 498 nt | BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC127024.5-201 | ENST00000580085 | 462 nt | BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PSMD5-AS1-203 | ENST00000589026 | 525 nt | TSL 5 BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010857.1-201 | ENST00000606398 | 594 nt | BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091979.2-201 | ENST00000607514 | 214 nt | BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RASA1-203 | ENST00000506290 | 3009 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SALL4P2-201 | ENST00000423288 | 2910 nt | BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NECAB1-202 | ENST00000521366 | 2908 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ART3-202 | ENST00000349321 | 1528 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNF180-202 | ENST00000389100 | 4906 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FOXP1-IT1-201 | ENST00000498714 | 3539 nt | TSL 2 BASIC | 4.71 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CFAP70-203 | ENST00000355577 | 3691 nt | TSL 5 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADAM24P-201 | ENST00000398655 | 2101 nt | BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL034370.1-201 | ENST00000397254 | 1590 nt | BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CUL2-209 | ENST00000537177 | 4271 nt | TSL 5 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADNP-201 | ENST00000349014 | 5963 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADGRG2-203 | ENST00000356606 | 4630 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KSR2-202 | ENST00000425217 | 17008 nt | TSL 5 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC4A10-203 | ENST00000415876 | 5578 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEP192-203 | ENST00000506447 | 7960 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KIF3A-203 | ENST00000403231 | 2181 nt | TSL 2 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DDHD2-202 | ENST00000517385 | 4113 nt | TSL 2 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CASC19-255 | ENST00000641733 | 1385 nt | BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | POLR2B-203 | ENST00000431623 | 3666 nt | TSL 2 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTPRZ1-201 | ENST00000393386 | 8175 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLD1-203 | ENST00000356327 | 5855 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LGALS13-201 | ENST00000221797 | 602 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-23P-201 | ENST00000362839 | 140 nt | BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | U3.35-201 | ENST00000408405 | 208 nt | BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GLS-204 | ENST00000409428 | 816 nt | TSL 2 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TMSB10P2-201 | ENST00000416049 | 131 nt | BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P57-201 | ENST00000423238 | 740 nt | BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092811.1-201 | ENST00000428642 | 397 nt | TSL 3 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02529-201 | ENST00000429657 | 772 nt | TSL 3 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL451140.1-201 | ENST00000430534 | 371 nt | TSL 3 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FTLP19-201 | ENST00000433300 | 394 nt | BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL136084.2-202 | ENST00000433997 | 353 nt | TSL 2 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC004938.1-201 | ENST00000438468 | 308 nt | BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU7-157P-201 | ENST00000459600 | 66 nt | BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SEPT7P6-201 | ENST00000469999 | 1143 nt | BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010476.1-201 | ENST00000519111 | 851 nt | BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DERA-209 | ENST00000532964 | 854 nt | TSL 5 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC125603.1-201 | ENST00000552718 | 366 nt | TSL 3 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC105339.2-201 | ENST00000558342 | 1091 nt | TSL 3 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087477.6-201 | ENST00000559595 | 843 nt | BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC055874.1-201 | ENST00000561458 | 479 nt | TSL 2 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3160-1-201 | ENST00000577972 | 85 nt | BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3908-201 | ENST00000579798 | 126 nt | BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL713998.2-201 | ENST00000604538 | 1198 nt | BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |