Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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CUL4AQ13619 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL4AQ13619 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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