Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PICALMQ13492 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms