Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TRIM28Q13263 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
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