Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 NSD2-208ENST00000420906 5109 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 LINC00906-202ENST00000587998 648 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
MCCD1P59942 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms