Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CASQ1P31415 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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CASQ1P31415 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.61
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CASQ1P31415 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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CASQ1P31415 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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CASQ1P31415 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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CASQ1P31415 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CASQ1P31415 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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