Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 SLC36A3-201ENST00000335230 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC008467.1-201ENST00000512693 5471 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TRHP20396 LMLN-201ENST00000330198 7043 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 SEMA6A-210ENST00000510263 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 SLFN11-202ENST00000394566 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 EIF4BP5-201ENST00000567338 1795 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC079598.4-201ENST00000549647 265 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 TMEM135-201ENST00000305494 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 SLC16A12-201ENST00000371790 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 LINC01358-211ENST00000635571 1687 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 MFAP5-203ENST00000433590 2308 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 MAPK10-345ENST00000641724 2980 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TRHP20396 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC022150.4-201ENST00000598322 2848 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 AC008758.1-201ENST00000428311 4505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 EPB41L1-201ENST00000202028 3514 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 SERPINA1-208ENST00000448921 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 SCMH1-205ENST00000372595 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TRHP20396 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms