Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MTSS1O43312 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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