Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ERVV-1B6SEH8 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms