Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms