Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SH3BP1Q9Y3L3 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SH3BP1Q9Y3L3 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SH3BP1Q9Y3L3 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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SH3BP1Q9Y3L3 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP1Q9Y3L3 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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