Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TMOD4Q9NZQ9 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TMOD4Q9NZQ9 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TMOD4Q9NZQ9 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TMOD4Q9NZQ9 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TMOD4Q9NZQ9 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TMOD4Q9NZQ9 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
TMOD4Q9NZQ9 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TMOD4Q9NZQ9 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TMOD4Q9NZQ9 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TMOD4Q9NZQ9 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TMOD4Q9NZQ9 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TMOD4Q9NZQ9 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TMOD4Q9NZQ9 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TMOD4Q9NZQ9 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.1 ms