Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CIPCQ9C0C6 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CIPCQ9C0C6 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CIPCQ9C0C6 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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CIPCQ9C0C6 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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CIPCQ9C0C6 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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CIPCQ9C0C6 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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