Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
TRAPPC9Q96Q05 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms