Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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SGF29Q96ES7 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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SGF29Q96ES7 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SGF29Q96ES7 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SGF29Q96ES7 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SGF29Q96ES7 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SGF29Q96ES7 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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