Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RAB6CQ53S08 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms