Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
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VPS72Q15906 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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VPS72Q15906 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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VPS72Q15906 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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VPS72Q15906 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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VPS72Q15906 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
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VPS72Q15906 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
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VPS72Q15906 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
VPS72Q15906 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
VPS72Q15906 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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