Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CCDC85BQ15834 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 BX119917.1-201ENST00000432517 502 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CCDC85BQ15834 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms