Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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SIX1Q15475 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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SIX1Q15475 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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SIX1Q15475 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SIX1Q15475 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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