Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDCD1Q15116 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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