Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
RFTN1Q14699 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RFTN1Q14699 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms