Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CNGB1Q14028 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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