| RUNX3 | Q13761 | POLR2B-213 | ENST00000639658 | 3300 nt | TSL 5 BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DENND4A-201 | ENST00000431932 | 5875 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MLIP-213 | ENST00000514921 | 5743 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CD226-201 | ENST00000280200 | 12319 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTPRD-213 | ENST00000537002 | 8224 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.75 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DLC1-209 | ENST00000511869 | 2451 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VRK2-206 | ENST00000435505 | 2446 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL731566.1-201 | ENST00000620490 | 1937 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01923-203 | ENST00000456248 | 2528 nt | TSL 2 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011287.1-206 | ENST00000638774 | 2642 nt | TSL 5 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR5M3-201 | ENST00000312240 | 1051 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4K17-201 | ENST00000315543 | 1032 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR6C69P-201 | ENST00000394268 | 893 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP59-201 | ENST00000399415 | 461 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL050305.1-201 | ENST00000399993 | 1230 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007738.1-201 | ENST00000413892 | 348 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009506.2-201 | ENST00000420635 | 840 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL158166.2-201 | ENST00000420845 | 748 nt | TSL 2 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FHP1-201 | ENST00000442741 | 703 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090589.1-201 | ENST00000473109 | 362 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL41P-201 | ENST00000476144 | 297 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097110.1-201 | ENST00000507344 | 768 nt | TSL 2 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC097491.1-201 | ENST00000507857 | 672 nt | TSL 5 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HNRNPRP2-201 | ENST00000528421 | 743 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001775.2-201 | ENST00000531710 | 334 nt | TSL 2 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL161752.1-201 | ENST00000557721 | 263 nt | TSL 2 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC015660.2-201 | ENST00000561362 | 323 nt | TSL 3 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PSMG2-204 | ENST00000585331 | 983 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006504.5-201 | ENST00000588122 | 655 nt | TSL 5 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC105094.2-202 | ENST00000590968 | 566 nt | TSL 2 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA35B-201 | ENST00000607417 | 129 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z95327.3-201 | ENST00000610385 | 572 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IBTK-206 | ENST00000503631 | 3560 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SMC2-202 | ENST00000374787 | 4266 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATF7IP-214 | ENST00000540793 | 4142 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SREK1-203 | ENST00000380918 | 2433 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01933-204 | ENST00000524295 | 3591 nt | TSL 2 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNCA-AS1-201 | ENST00000501215 | 2646 nt | TSL 2 BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091046.3-201 | ENST00000631455 | 1574 nt | BASIC | 4.74 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KIF21A-201 | ENST00000361418 | 5044 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DDX18P5-201 | ENST00000534547 | 1306 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C3orf67-AS1-202 | ENST00000482372 | 2203 nt | TSL 2 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LUZP2-207 | ENST00000533227 | 5016 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008079.2-201 | ENST00000623543 | 20396 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PIGN-242 | ENST00000640145 | 4505 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC009951.1-201 | ENST00000623674 | 2614 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SLC10A7-202 | ENST00000394059 | 1730 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4K13-201 | ENST00000315693 | 915 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UQCR10-201 | ENST00000330029 | 916 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR659-201 | ENST00000384963 | 97 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SDHCP2-201 | ENST00000398565 | 501 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR1193-201 | ENST00000408109 | 78 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC095032.2-201 | ENST00000414923 | 418 nt | TSL 2 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073521.1-201 | ENST00000418679 | 625 nt | TSL 3 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RGS17P1-201 | ENST00000423358 | 553 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GAS5-208 | ENST00000425771 | 242 nt | TSL 3 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01731-201 | ENST00000428035 | 420 nt | TSL 3 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL606490.8-201 | ENST00000441624 | 319 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C2orf80-207 | ENST00000453017 | 722 nt | TSL 3 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCYBP14-201 | ENST00000457471 | 715 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL303P-201 | ENST00000469773 | 251 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TFDP2-211 | ENST00000479040 | 1201 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NPM1P28-201 | ENST00000492269 | 840 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC098799.3-201 | ENST00000506095 | 438 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02278-201 | ENST00000512170 | 500 nt | TSL 5 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NPM1P6-201 | ENST00000521088 | 871 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PTH-202 | ENST00000529816 | 799 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068643.1-201 | ENST00000548594 | 755 nt | TSL 5 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021351.1-201 | ENST00000560886 | 652 nt | TSL 5 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073878.2-201 | ENST00000565449 | 385 nt | TSL 3 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR3138-201 | ENST00000585238 | 82 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR99AHG-211 | ENST00000602323 | 475 nt | TSL 5 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005162.3-202 | ENST00000609495 | 483 nt | TSL 5 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02335-201 | ENST00000616578 | 659 nt | TSL 3 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FRG1EP-201 | ENST00000634469 | 770 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MS4A14-203 | ENST00000395005 | 2813 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TM4SF1-202 | ENST00000472441 | 3115 nt | TSL 2 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000542.2-201 | ENST00000623199 | 6179 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CD80-204 | ENST00000478182 | 1491 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCN3A-202 | ENST00000360093 | 9123 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ST7-212 | ENST00000422922 | 1887 nt | TSL 5 BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PROS2P-201 | ENST00000474651 | 1951 nt | BASIC | 4.73 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARHGAP42-203 | ENST00000524892 | 5685 nt | TSL 5 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SDC2-204 | ENST00000519914 | 1318 nt | TSL 2 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000756.2-201 | ENST00000624168 | 2567 nt | BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRIM69-201 | ENST00000329464 | 1901 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR8H3-201 | ENST00000313472 | 939 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KRTAP3-2-201 | ENST00000391587 | 702 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ARL4AP5-201 | ENST00000404372 | 599 nt | BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIRLET7DHG-201 | ENST00000416309 | 1294 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL17P36-201 | ENST00000420302 | 549 nt | BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL354766.1-201 | ENST00000423396 | 542 nt | BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS29P17-201 | ENST00000430795 | 166 nt | BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL23AP93-201 | ENST00000440847 | 484 nt | BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC112184.1-201 | ENST00000505179 | 312 nt | BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC105914.2-201 | ENST00000507525 | 233 nt | TSL 3 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011131.1-201 | ENST00000521224 | 252 nt | TSL 2 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC021242.2-201 | ENST00000522765 | 454 nt | TSL 3 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL035078.3-201 | ENST00000525382 | 241 nt | TSL 3 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP003557.1-202 | ENST00000528978 | 562 nt | TSL 4 BASIC | 4.72 | □□□□□ -1.65 | | |