Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
ATP1A4Q13733 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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