Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL1Q13616 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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