Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SGCGQ13326 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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