Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RN7SL153P-201ENST00000486501 292 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 GLYATL1P4-201ENST00000529326 906 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 OR5F2P-201ENST00000532761 941 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 IQCA1-204ENST00000409907 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 WNK1-220ENST00000574564 1401 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SCIN-209ENST00000519209 2660 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ABRAXAS2-201ENST00000298492 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 DUBR-202ENST00000466734 2737 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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CLN3Q13286 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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CLN3Q13286 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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CLN3Q13286 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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CLN3Q13286 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 Z83313.1-201ENST00000433780 718 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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CLN3Q13286 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 IGLVVII-41-1-201ENST00000518405 151 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC246817.1-201ENST00000520024 610 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC097381.3-201ENST00000608962 462 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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