Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SRSF5Q13243 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms