Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NME3Q13232 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NME3Q13232 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NME3Q13232 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NME3Q13232 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NME3Q13232 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NME3Q13232 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NME3Q13232 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NME3Q13232 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NME3Q13232 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NME3Q13232 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms