Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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GPS1Q13098 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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GPS1Q13098 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
GPS1Q13098 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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