Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CENPFP49454 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CENPFP49454 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CENPFP49454 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms