Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRMP28827 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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PTPRMP28827 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
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PTPRMP28827 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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PTPRMP28827 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRMP28827 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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