Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
HOXD10P28358 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
HOXD10P28358 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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