Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CEP290O15078 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CEP290O15078 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CEP290O15078 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CEP290O15078 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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CEP290O15078 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CEP290O15078 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CEP290O15078 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CEP290O15078 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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