Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
USP17L18D6R9N7 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms