Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-2B6SEH9 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-2B6SEH9 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-2B6SEH9 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-2B6SEH9 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-2B6SEH9 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-2B6SEH9 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-2B6SEH9 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-2B6SEH9 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-2B6SEH9 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-2B6SEH9 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-2B6SEH9 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-2B6SEH9 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-2B6SEH9 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-2B6SEH9 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-2B6SEH9 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ERVV-2B6SEH9 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ERVV-2B6SEH9 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms